В мрачных закоулках поднебесной игры власти и предательства, «Секретные материалы» открывают завесу над мрачной реальностью, где бывшие преступники и обманутые герои, запятнанные своими поступками, ведут борьбу с самим собой. Под чутким руководством Валентины Аллегры Де Фонтейн, безжалостной главы ЦРУ, они стараются стереть следы гуманитарных катастроф, вызванных аморальными экспериментами. Елена Белова, Джон Уокер, Ава Старр и Антония Дрейкова оказываются в ловушке, где их жизни переплетаются не только с задачами, но и с непредсказуемыми интригами, заставляющими каждый миг колебаться между альтруизмом и выживанием.
Когда они встречаются на секретном объекте, страх и недоверие становятся их единственными спутниками. Нагнетающая атмосфера паранойи в сочетании с личными демонами каждого из них рисует сложный портрет человеческой природы, общества, где каждый шаг может обернуться предательством. Им предписано убить друг друга, и в этом безумии нарастает непреодолимое желание найти истину, даже если она болезненна. Эмоции накаляются, а внутренние конфликты разрастаются, не оставляя выбора в мире, где единственным законом становится правило «любой ценой».